Chương trình dành cho học sinh trung học cơ sở được xây dựng trên kiến thức và các kỹ năng học ở trường tiểu học và tạo mọi điều kiện cho học sinh thành công trong trường trung học. AIS cung cấp những lựa chọn đa dạng và linh động của các chương trình giảng dạy ở cấp trung học cơ sở gồm: Chương trình BGD Viet Nam, chương trình Quốc tế ,Maths , Sciences. Chương trình hội họa, âm nhạc, chương trình tiếng Anh ESL cơ hội nhận chứng chỉ quốc tế Cambridge, TOEFL. TOEIC…
Các chương trình giảng dạy Maths sẽ giúp học sinh nâng cao ngôn ngữ tiếng Anh toán học biết cách giải quyết vấn đề và xây dựng một nền tảng cho các khóa học toán học cao cấp hơn. Chương trình Sciences dựa trên phòng thí nghiệm và khảo sát thực địa thông qua học tập dã ngoại tập trung vào những đề tài nghiên cứu môi trường thiên nhiên , xã hội cùng với mối quan hệ bên trong của chúng. Học sinh sẽ trở nên năng động và thích thú tham gia thực nghiệm khoa học như chính các em đang tìm hiểu thế giới xung quanh mình.
Đối với các môn học xã hội học sinh sẽ tìm hiểu về địa lý, văn hóa, lịch sử Việt Nam và Mỹ. Các môn giáo dục sức khỏe, thể chất sẽ là những hoạt động thể thao đa dạng phù hợp với năng khiếu và thể chất từng học sinh.
Công nghệ thông tin được giảng dạy chính quy với phòng Lab trang thiết bị đầy đủ phục vụ khóa học song song với các chương trình âm nhạc, hội họa, kịch nghệ, kihêu vũ, ngoại ngữ…Ngoài ra, còn nhiều hoạt động ngoại khóa, hoạt động CLB bơi lội, Aerobic ,cầu lông, bóng chuyền, đá bóng ...phù hợp với tâm sinh lý lứa tuổi. Mỗi học kỳ và mổi năm học sinh được tổ chức thi đua các môn năng khiếu.
